JLF UK začala s výučbou všeobecného lekárstva v roku 1962 ako detašované klinické pracovisko Lekárskej fakulty UK v Bratislave. O niekoľko rokov neskôr, 21. júla 1969, vznikla samostatná Lekárska fakulta UK so sídlom v Martine – inštitúcia, ktorá sa postupne vyprofilovala na rešpektované centrum medicínskeho vzdelávania. V akademickom roku 1990/1991 ako prvá na Slovensku otvorila vysokoškolské štúdium v odbore ošetrovateľstvo. Už o rok neskôr spustila ako prvá na Slovensku výučbu všeobecného lekárstva v anglickom jazyku pre zahraničných študentov. Od roku 2000 postupne zavádzala kreditový systém ECTS, čím zosúladila štúdium s európskymi štandardmi. Významným míľnikom bola aj akreditácia študijných programov v roku 2004, ktorá priniesla nové nelekárske študijné programy a ďalšie skvalitnenie výučby. Dnes fakulta poskytuje komplexné vzdelávanie v doktorandských študijných programoch 3. stupňa, v špecializačných programoch, ako aj v štúdiu všeobecného a zubného lekárstva a nelekárskych zdravotníckych odboroch. Všetky študijné programy sú akreditované v súlade s platnou legislatívou a spĺňajú náročné kritériá kvality.

Absolventom študijných programov všeobecné lekárstvo, zubné lekárstvo, ošetrovateľstvo a pôrodná asistencia pre prípravu regulovaných povolaní je v rámci platnej legislatívy zabezpečené automatické uznanie diplomu v krajinách EU.

JLF UK tak predstavuje spojenie tradície, inovácie a medzinárodnej otvorenosti – miesto, kde sa rodia odborníci pripravení meniť svet zdravotníctva k lepšiemu.