Aktivity
Aktivita 1.1 Vypracovanie návrhu nového diagnostického algoritmu v súčinnosti teoretických a klinických pracovísk
Cieľom aktivity bolo vytvorenie komplexného detailného návrhu nového diagnostického postupu využiteľného v klinickej praxi pri sledovaní remisie/progresie tumorov CNS.
Komplexným výstupom aktivity je vytvorenie nového diagnostického postupu resp. metódy plne využiteľnej v klinickej praxi. Vo výskume boli uplatnené tieto metodiky:
1. Zobrazovania/spektroskopie magnetickou rezonanciou (MRI/MRS) - rádiodiagnostická metóda, umožňujúca odhalenie patologických zmien v ľudskom organizme bez nutnosti narušiť integritu tela vyšetrovanej osoby operáciou alebo iným invazívnym zásahom.
Príklad zobrazenia CNS pomocou MRI/S. Spektroskopia vybraných oblastí CNS. a – spektrum zdravého tkaniva, B – spektrum hraničnej oblasti, C – spektrum tumoru
2. DNA array je moderná vysoko výkonná metóda umožňujúca simultánne stanovenie prítomnosti niekoľkých sekvencií DNA či mRNA vo vyšetrovanom tkanive. Prostredníctvom predmetnej metódy je možné stanovenie mutácii polymorfizmov DNA alebo určitého typu mRNA. Metóda využíva tzv. DNA čipy.
Výstup z čítačky DNA čipov pri profilovaní génovej expresie, farebnosť a inenzita signálu zodpovedá kvalite a množstve príslušnej mRNA
3. MTT test je metóda umožňujúca určiť prežívanie buniek, je založená na schopnosti živých buniek oxidovať žltý vo vode rozpustný tetrazol (MTT) na fialový nerozpustný formazan.
Nádorové bunky izolované z vyoperovaného glioblastómu
Aktivita 1.2 Realizácia imunohistochemických a molekulovo-genetických analýz ako podstaty novo vznikajúcej metódy
Cieľom aktivity je optimálne využitie dostupných molekulovo-genetických analýz a imunohistochemických analýz tak, aby bola stanovená čo najúčinnejšia metóda sledovania progresie tumorov CNS.
Komplexným výstupom aktivity je vytvorenie vyriešenej jednej etapy prípravy nového diagnotického postupu resp. metódy plne využiteľnej v klinickej praxi pomocou imunohistochemických vyšetrení.
1. Imunohistochemické vyšetrenie využíva protilátky na detekciu príslušnej bielkoviny v určitom type buniek ako aj na bližšie určenie štruktúr a morfológiu buniek v určitom type tkaniva. Pomocou tejto metódy možno nielen detegovať prítomnosť nádorových buniek v príslušnom tkanive ale aj bližšie charakterizovať nádorové bunky najmä s ohľadom na štádium ako aj prognózu ochorenia. V rámci tohto projektu sme kvôli vyššej výkonnosti a lepšej zobrazovacej schopnosti navrhli využitie konfokálneho mikroskopu.
Konfokálny mikroskop
Aktivita 1.3 Podpora národnej a medzinárodnej spolupráce v oblasti nových možností diagnostiky a terapie nádorových ochorení
Cieľom aktivity je vytváranie nových projektových zámerov a podpora národnej a medzinárodnej spolupráce tímov výskumníkov zaoberajúcich sa problematikou onkologických ochorení.
Výstupom aktivity bola priebežná propagácia výsledkov výskumu a budovanie medzinárodného tímu podporujúceho výskum v oblasti diagnosticky a terapie onkologických ochorení, translačnej medicíny a personalizovanej terapie. V rámci projektu odborní riešitelia budujú národnú a medzinárodnú spoluprácu s centrom MR Excelencie vo Viedni, komunikujú o možnej medzinárodnej spolupráci – spoločné pokusy s cieľom zjednotenia metodík s prof. Annunziato, prof. Pochet, prof. Michettim a prof. Dringen a hľadajú možnosti spolupráce s UEM AV ČR Praha a spoločné postupy s UEM AV ČR.
Aktivita 2.1 Vytvorenie softvérového zázemia pre zavedenie nových diagnostických a terapeutických postupoch pri nádorových ochoreniach
Cieľom aktivity je kvalitné softvérové zabezpečenie.
Výstupom aktivity je unikátne softvérové zázemie pre aproximáciu a vizualizáciu relaxačných T1 a T2 máp z MRI dát partenerom projektu zo Žilinskej univerzity.
Aktivita 2.2 Podpora národnej a medzinárodnej spolupráce v možnostiach vytvárania softvérových zázemí pri diagnostických a terapeutických postupoch pri nádorových ochoreniach
Vytvorenie úspešnej interdisciplinárnej spolupráce na národnej a medzinárodnej úrovni v oblasti vytvárania softvérových zázemí využiteľných v klinickej medicínskej praxi.
Výstupom aktivity bola národná a medzinárodná spolupráca v oblasti softvérovej architektúry využiteľnej v medicíne - Ontario Cancer Institute v Kanade, Aviano v Taliansku.